中心安装有先进的智能化楼宇管理系统，包括烟雾报警、视频监视系统和红外线报警等自动报警系统，设置了防火安全通道标志，配备完善消防器材，符合国家消防工程设计及建筑物安全防火标准规范，实现了防火、防爆、防盗、防破坏四防措施。大楼的安全由学校保卫处负责。
实验室电源容量、通风、照明条件达到设计标准。所有实验室和实验准备室均安装大功率空调，能对实验室的温、湿度进行控制。实验室水、电布局安全、规范、无污染或有害物质、无三废和放射性物质，符合国家安全环保标准。对有毒、易燃、易爆等物品的使用，制定了严格的操作规程，采取有效的防护措施。
中心实验室消防等设施经过了消防局的验收并合格通过。实验中心楼内设有灭火器及消防水栓，各实验室均安装了烟雾自动报警装置。
学校每学期都要对中心进行全面的安全检查，发现隐患及时整改，中心自成立以来从未发生安全事故。即使在“5.12”大地震期间，实验室也接受住了考验。
实验室内布局合理，器材设备摆放整齐，桌面、仪器无灰尘，地面无尘土、无积水、无纸屑、无烟头等垃圾，室内布局合理，整洁明亮，并实现了低噪音，为学生营造了一个良好的实验环境和氛围。
中心十分重视对师生进行安全教育，学生初次进入实验室时，实验教师都按规定先介绍实验室的安全条例和安全实验的知识。
上述这些措施确保了师生能在一个良好、安全、环保的环境中进行有序地实验教学和科学研究。
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